Метод с dd хорошо работает.
Вот еще несколько полезных утилит:
Clonezilla
http://clonezilla.org/
rsnapshot
http://www.thegeekstuff.com/2009/08/tutorial-backup-linux-using-rsnapshot-rsync-utility/
dd-rescue
http://www.howtoforge.com/ntfs-disk-recovery
http://www.myfixlog.com/fix.php?fid=21
ntfs-clone